python-xarray

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    使用xarray合併基於列的熊貓數據框

    我有一個數據框字典，其中每個字典鍵對應於樣本名稱，數據框本身有一個「時間」列和一些測量列（溫度，濃度等）。時間列在樣本中不一致（不同樣本的開始和結束時間不同，儘管我認爲所有時間點在開始和結束之間都被測量/具有相同的dT）。 我想合併所有的數據到一個單一的xarray，其中一個軸是時間，另一個軸是測量類型，第三個軸是樣本名稱。由於並非所有時間都是針對所有樣本進行測量的，因此應將丟失的數據替換爲nan
    python-3.x pandas python-xarray 2017-10-21

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    增加維度從座標

    一個xarray的說我有以下的2D陣列 >>> import numpy as np >>> budgets = np.array([ [np.nan, 450.], [500. , 100.], [np.nan, 900.], ]) ，其值被設置像這樣 >>> coords = [ ('name' , ['Jack_teen' ,
    python-xarray xarray 2017-09-06

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    如何在添加新項目時使用熊貓面板等xarray

    我已將pandas面板轉換爲xarray，但無法像熊貓面板一樣輕鬆地添加新項目，主軸和副軸。代碼如下： import numpy as np import pandas as pd import xarray as xr panel = pd.Panel(np.random.randn(3, 4, 5), items=['one', 'two', 'three'],
    pandas panel python-xarray xarray 2017-09-09

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    應用功能上在Xarray

    我xarray座標使用多個變量沿特定軸的一對Dataset具有三個維度， x，y，t 和2個變量， foo，bar 我想每個x應用功能baz()，y座標對的時間序列t baz()將接受foo -s對於一個給定的數組，並和bar -s陣列（x，y） 我很難理解在xarray，pandas，numpy或dask中是否存在用於處理/分發它的結構。 任何提示？ 我目前的做法是寫一個python陣列迭代器，
    python-3.x numpy dask python-xarray 2017-09-13

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    在創建NetCDF 0替換INF值在python

    我可以使用的NetCDF像xarray這個替換NaN值： hndl_nc = hndl_nc.fillna(0.0) 有沒有辦法用0和更換INF值？
    python netcdf python-xarray 2017-09-17

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    netCDF4.Dataset簡單轉換爲xarray數據集

    我知道如何手動將netCDF4.Dataset轉換爲xarray DataArray。不過，我想知道是否有簡單而優雅的方式，例如使用xarray後端，以下「netCDF4.Dataset」對象的簡單轉換爲xarray於DataArray對象： <type 'netCDF4.Dataset'> root group (NETCDF4 data model, file format HDF5):
    python netcdf python-xarray siphon 2017-09-26

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    如何使用groupby下采樣xarray數據集？

    我想對基於特定組的xarray數據集進行縮減採樣，因此我使用groupby來選擇組，然後在每個組中使用10％的樣本。我使用下面的代碼，但我得到IndexError: index 1330 is out of bounds for axis 0 with size 1330這暗示我的函數返回一個空數組，但subset肯定有非零維。 我正在使用squeeze=True，我認爲這將允許根據GroupBy
    python python-xarray xarray 2017-09-29

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    xarray和每月或每年航空航班的xarray和5年平均值

    我需要從月平均或年平均時間序列數據中計算5年的平均數據（不是滾動平均值，而是日曆年）。 搜索xarray文檔後，我看不到一個簡單的方法來做到這一點。 有沒有人有做這種類型的平均方法？ 謝謝！
    time-series average mean python-xarray xarray 2017-10-06

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    python-xarray：open_dataarray HPC上的分割錯誤

    我在努力理解爲什麼在我使用的HPC中使用open_dataarray的NetCDF文件中的讀取產生Segmentation fault (core dumped)。但是，當我在我的Mac上使用open_dataarray在文件中讀取時，它工作正常。 從進一步調查這是我創建似乎有問題的NPac文件（小節）。下面是我把生成文件的步驟： WaveWatchIII輸出文件 提取七月：$ncks -d ti
    netcdf python-xarray 2017-12-03

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    從元數據+值創建xarray數據集的簡單方法？

    我正在使用最近10k-100k樣本（cell s）x 20k特徵（gene s）稀疏值的單細胞RNA測序數據，並且還包含大量元數據，例如，起源的組織（「大腦」與「肝臟」）。元數據是〜10-100列，我存儲爲pandas.DataFrame。現在，我正在製作xarray.DataSets字典，並將它們添加爲座標。由於我在筆記本之間複製片段，因此它看起來很笨重且容易出錯。有更容易的方法嗎？ cell_
    python data-science python-xarray xarray 2017-10-17
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