sungridengine

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在SGE，我們有 qsub -now yes/no <command> 通過「 - 現在是」作業立即安排（如果可能的話），或者根本沒有。我們沒有進入待決隊列。通過「-now no」，如果該作業不能立即執行，則將該作業放入待處理隊列中。但是在LSF中，我們有qsub等價於bsub。在bsub中，如果不能立即執行，我們將被放入待處理隊列。我們沒有像qsub中的「現在是」這樣的選項。難道我們在B

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將輸出重定向到太陽網格引擎陣列作業（SGE）的不同文件

我正在嘗試執行太陽網格引擎數組作業，並且我需要每個任務的不同輸出文件：test.1.out test.2.out等.. 如果我寫我的劇本是這樣的： #!/bin/bash #$ -S /bin/bash #$ -N name #$ -t 1-4000 #$ -o /home/myuser/out/test.$TASK_ID.out #$ -e /home/myuser/err/test.

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爲什麼python DRMAA庫（drmaa-python）有時無法確定提交給SGE（UNDETERMINED）的作業的狀態？

我正在使用drmaa-python來向SGE（Sun Grid Engine）提交和監控作業。我在GUI下面的狀態喬布斯活躍在隊列運行作業完成的工作與狀態失敗的作業地位未定有時我得到一些工作未確定。當我在SGE主機的終端上使用qstat檢查作業狀態時，我可以看到所有作業都沒有失敗。狀態未確定經常誤導用戶，因爲用戶可能認爲狀態未確定作業存在某種問題。所以，我明白這個問題不是用SGE，

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SGE + sqlite3：錯誤：數據庫被鎖定

我試圖運行在集羣中使用sqlite3的腳本（SGE）。該腳本創建與lockfile鎖，填充數據庫，並釋放鎖。 $cat test.sh #!/bin/sh lockfile /commun/data/_tmp.idp448.lock sqlite3 /commun/data/stats.sqlite "create table if not exists time

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什麼是'千兆字節秒'？

從qstat命令（的Sun Grid Engine）手冊頁： MEM：以GB爲單位秒作業的當前累積的內存使用情況。這是什麼意思？

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如何使用的qsub

考慮一個腳本，「run.sh」，發送到通過使用qsub集羣作業隊列獲得在陽光網格系統的JOB_ID， qsub ./run.sh 我的問題是我怎麼得到進程號 - 在腳本run.sh內的文件* .o $ {PID}和* .e $ {PID}上顯示爲$ {PID}的進程號 - qsub是否導出？在哪個名字？

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不包括來自sge下的qsub命令的節點

我有超過200個工作需要提交給sge集羣。我會把它們提交給兩個問題。其中一個問題有一臺我不想提交工作的機器。我如何排除該機器？我發現，可能會有所幫助的唯一的事情是（假設提供給Q1三個有效的節點和所有Q2的可用節點是有效的）： qsub -q [email protected] [email protected] [email protected] q2.q

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使用sge集羣在Matlab下運行C++代碼？

我有一個運行C++函數的matlab代碼，它可以在我的電腦或任何其他我嘗試運行它的桌面上運行。（以其他桌面上運行我複製了MATLAB/C++函數和MEX文件），我試圖運行SGE集羣上的代碼但最近我得到一個錯誤messege 「未定義函數'img'用於'double'類型的輸入參數「」img「是由matlab調用的C++函數。沒有人遇到同樣的問題嗎？有誰知道如何解決它？ 10X 埃拉德

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註釋中的變量擴展

是否可以在bash腳本中的註釋中擴展變量？我想寫一個腳本來餵養SGE。 qsub語法允許我使用bash腳本中以#$開頭的行將其他參數傳遞給Grid Engine。例如， #$ -q all.q #$ -S /bin/bash #$ -V #$ -m beas #$ -o run_20120103.out 我想的是，-o參數是動態設置爲變量，說$1。所以，我天真地寫 #$ -o run

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提交打開MPI作業到SGE

我已經安裝了openmpi，而不是在/usr/...中，但是在/commun/data/packages/openmpi/中，它已編譯爲--with-sge。我已在SGE新的PE爲descibed在http://docs.oracle.com/cd/E19080-01/n1.grid.eng6/817-5677/6ml49n2c0/index.html # /commun/data/packag