imagej

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    這是一個基本問題,但我無法在任何地方找到答案。 在ImageJ中對宏使用run命令時,如何使用宏設置複選框(手動運行時會看到)。 例如。我有: 運行(「扣除背景......」,「半徑= 1」) 但我想自動檢查框滑動拋物面,這樣的事情: 運行(「扣除背景...「,」半徑= 1「,」滑動拋物面=真「) 或者這是一個單獨的每個過程的設置命令?

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    我是ImageJ的新手,並試圖使用Python(在ImageJ宏編輯器中)重新創建以下宏。 s = selectionType(); if(s == -1) { exit("There was no selection."); } else if(s != 10) { exit("The selection wasn't a point selection."); }

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    我想從命令行p.e中調用Jython腳本。 $ /Applications/Fiji.app/Contents/MacOS/ImageJ-macosx --headless little_jython_script.py 我知道通過 import sys params = sys.argv[1:] ,然後調用的東西,如 $ /Applications/Fiji.app/Contents/Ma

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    我正在與斐濟合作進行圖像分析。 我有兩個* .tif堆棧從一個微觀樣本,其中一個稍微旋轉,並有一個z軸偏移量。這就像一個螺絲擰入的量不同於第一個。 如何對齊這兩個堆棧,以便旋轉和z軸偏移均勻?斐濟/ Imagej是正確的計劃嗎?我需要一個插件嗎? 由於事先已經:)

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    我正在嘗試使用ImageJ中的this java class來消除我在java中的圖像。 我嘗試使我結合這個測試類these two classes (the github page linked to from ImageJ's website): import ij.ImagePlus; import ij.process.ByteProcessor; import ij.process.

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    我找到this post which uses the IJ.runMacro()方法,但我對「小丑(14K)」所指的內容感到困惑,而且我想使用我自己創建的宏,而不是一個從imageJ的網站下載。 我的宏就是這個現在: run("Non-local Means Denoising", "sigma=5 smoothing_factor=1"); 和ImageJ中的作品,當我使用批量處理器。 (

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    我正在嘗試查找可重複的過程以從圖像中查找網格交點的座標。該圖像是許多較小圖像的蒙太奇。蒙太奇的每個「瓦片」都具有不一致的對比度,所以我的幼稚方法失敗(瓦片邊界被選中)。一個小例子: 我從思想有輕微的進步How to remove convexity defects in a Sudoku square?解釋和Grid detection in matlab 然而,網格線不一定直在整個圖像,所以不能

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    讓我解釋一下。 我的程序以X射線檢測器「.his」的格式從0到65535進行X射線檢測,並從這些值中可以看出每個像素中的某種材料有多少「例如4釐米的鋁「。 它對每個像素都做了這樣的事情,最終得到一個矩陣,告訴您有多少給定的材料存在,並且您可以可視化該矩陣並僅看到圖像中的脂肪組織,而骨骼不會阻擋視圖,我知道這很酷。 我現在想要做的是將矩陣保存爲圖像,以便我可以使用像Image J這樣的程序分析和修改

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    我開始使用ImageJ和Micro Manager的大學項目。我希望能夠訪問從攝像頭快照獲取的圖像的每個像素。我的目標是能夠爲圖像的快照上的每個像素應用定製功能。有沒有可能使用ImageJ來做到這一點。

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    我有一個tiff文件,使用ImageJ在Z堆棧中排列多個灰度圖像,形成一個3D圖像。從這張圖片我想提取某些物體,即細胞體或軸突。 我不是在尋找自動分割,而是寧願手動選擇所需的區域。但是,我無法找到一款軟件,可以讓我在3D tiff圖像中繪製選區並導出選定的區域。 所以我的問題是,如果有這樣的軟件?