r-caret

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    我正在比較一堆我學習的數據集上的機器學習模型。在生產中目前的模式是以下形式的公式: y ~ a + b * x1^c * x2^d * x3^e, 因爲我想用目前的情況爲基準來評估改善我和其他型號的東西,我已經實現了它R使用: powerModel <- nls(y ~ a + b * x1^c * x2^d * x3^e, data = df, start

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    夥計們! 我是機器學習方法的新手,對此有疑問。我嘗試使用Caret包中的R啓動此方法並使用我的數據集。 我有一個關於我感興趣的基因的突變信息的訓練數據集(Dataset1),比如說基因A。 在dataSet1的,我有一個關於基因A在MUT或不-MUT形式的突變的信息。我使用數據集1與SVM模型來預測輸出(我選擇SVM,因爲它比LVQ或GBM更準確)。 因此,在我的第一步中,我將數據集分成了訓練組和

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    有沒有辦法控制插入符號中GA算法選擇的特徵的數量?我嘗試設置gafs_initial()中提到的變量參數,我相信這個參數是由gafs()繼承的,但我似乎沒有控制它的方法。 ctrl <- gafsControl(functions = caretGA, verbose = T, allowParallel = T, metric=c(internal='Rsquare

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    我試圖在R中使用包caretEnsemble來合成模型。這裏是一個最小可重現的示例。請讓我知道這是否應該有額外的信息。 library(caret) library(caretEnsemble) library(xgboost) library(plyr) # Load iris data and convert to binary classification problem da

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    插入符號如何保存最小尺寸模型。在這個例子中,gbmFit1包含gbmFit1$trainingData。保存gbmFit1保存所有這些變量。由於我的訓練數據很大,我想擺脫所有這些額外的變量,並希望以最小的尺寸保存模型。 library(mlbench) library(caret) data(Sonar) x <- Sonar[, colnames(Sonar)!="

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    讀取XGB vignette。 我們正在使用火車數據。如上所述,數據和標籤 都存儲在列表中。 在稀疏矩陣中,包含0的單元格不存儲在內存中。 因此,在一個主要由0組成的數據集中,內存大小會減小。它是非常平常的有這樣的數據組。 之後,小插圖告訴你如何使用密集矩陣。 我有一個從文本數據派生的數據框,因此非常稀疏,因爲大多數值都是零。我一直在將數據幀傳遞給XGB,並且需要很長時間才能運行,但也許是預期的。

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    我試圖在R中實現一個簡單的隨機森林算法,以瞭解R和隨機森林如何工作,並測試測試集中的準確性。 我的樣本數據(561個總行的五行)是: bulbasaur[1:5,] Appt_date count no_of_reps PerReCount 1 2016-01-01 2 1 2.000000 2 2016-01-04 174 58 3.000000 3 2016-01-0

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    我明白爲什麼並行處理只能在XGB訓練中使用,並且不能用於其他模型。然而,令人驚訝的是我注意到用xgb預測也使用了並行處理。 我注意到這個意外的時候我拆我的大10M +數據幀成塊預測使用的foreach %dopar%。這導致了一些錯誤,所以試圖解決它們我切換到順序循環與%do%但在終端注意到所有處理器在哪裏使用。 經過一些試驗和錯誤,我發現caret::train()似乎使用並行處理,其中模型只有

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    我有下述R腳本設置,其被設計使用插入符包建立從數據幀的模型: library(caret) library(broom) data<- data.table("mydata.csv") splitprob <- 0.8 traintestindex <- createDataPartition(data$fluorescence, p=splitprob, list=F) test

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    我收到此錯誤嘗試安裝包插入符號: ERROR: compilation failed for package ‘ddalpha’ * removing ‘/home/rspark/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.3/ddalpha’ Warning in install.packages : installation of package ‘d