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    集羣計算作業是立即提交還是持續訪問？

    我通常在集羣計算機上工作。我有一些非常大的Rscript用於運行數據。完整的Rscript需要大約5個小時才能運行。爲此，我通過使用qsub提交作業來使用羣集。這使我可以離開我的電腦並等待集羣運行。但是，我想運行這個特殊的Rscript 20個不同的次數進行微小的更改。 我一直在做的是等待集羣作業完成。然後進入Rscript並修改文件名，然後將另一個作業發送到羣集。 我的問題是這樣的：在我將作業提
    r cluster-computing qsub rscript 2016-06-07

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    命令專門對單個實例中cfncluster-SGE調度

    運行工作，我想用SGE調度的qsub選項專門作業提交到一個單一節點cfncluster。 有誰知道在cfncluster中保留或使用完整實例作業的正確方法。 qsub -l [email protected] script.sh 的作品，但我不想指定主機名，因爲我們不知道 主機節點，因爲它沒有被紡起來。有沒有任何選項來指定節點或核心的數量。謝謝。
    cluster-computing pbs qsub sungridengine 2016-07-27

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    QSUB：指定在工作陣列中的每個任務輸出和錯誤文件

    但願這不是一個dublicate，也不僅僅是我們的羣集配置的問題... 我使用qsub提交作業陣列集羣用下面的命令： qsub -q QUEUE -N JOBNAME -t 1:10 -e ${ERRFILE}_$SGE_TASK_ID /path/to/script.sh 其中 ERRFILE=/home/USER/somedir/errors. 的想法是指定錯誤文件（類似地也輸出文件）
    bash cluster-computing qsub sungridengine 2016-06-09

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    如何使用Torque在多個隊列中提交作業？

    使用qsub我可以在同一個隊列作業提交到多個節點： qsub -I -q normal -l nodes=2:ppn=16 不過，我有一個名爲超級另一個隊列，是否有可能在兩個不同的隊列提交作業？ 概念上的東西是這樣的： qsub -I -l queue=normal:nodes=2:ppn=16,queue=hyper:nodes=2:ppn=16
    qsub torque 2016-06-11

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    瞭解-t選項的qsub

    該文檔是有點不清楚的正是-t選項使用qsub http://docs.adaptivecomputing.com/torque/4-0-2/Content/topics/commands/qsub.htm 從文檔的作業提交做： - t指定作業數組的任務ID。單任務數組是允許的。 array_request參數是一個整數id或一個整數範圍。 可以在逗號分隔列表中組合多個ID或ID範圍。 例子：-t
    pbs qsub torque 2016-06-12

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    在隊列中編輯模擬文件

    假設我向PBS提交了一個文件（file1.pbs），並且它已經排隊。在這個文件中，我指的是計算機將運行的第二個文件（file2.namd）。然後，當file1.pbs排隊時，我在file2.namd中做了一個重要的更改。一旦保存了file2.namd，我就檢查這個作業，並且它仍然排隊（尚未運行）。 我的問題是：即使作業已經排隊，該更改是否會被執行，或者計算機是否已經讀取了file2.namd？ 謝
    pbs qsub 2016-06-13

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    PBS：如何打印作業運行的歷史記錄以及如何使用腳本名稱作爲PBS_JOBNAME？

    qsub和HPC的新成員。我有三個小問題： 我想知道哪個作業腳本對應哪個stderr和stdout。我知道我可以手動輸入工作名稱和他們的stderr和stdout像這樣（現在我使用$ PBS_JOBNAME。$ PBS_JOBID作爲stderr和stdout），但是從現在起6個月，我很難知道從中生成作業腳本stderr和stdout $ PBS_JOBNAME。$ PBS_JOBID。我正在考慮
    pbs qsub torque 2016-08-03

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    SGE faild提交作業，屬性不是內存值

    我未能提交具有mem屬性的作業。由於我是新手，谷歌兩天後，我在這裏尋求幫助。任何建議將不勝感激！ 以下是我所做的： \ 1。提交我的稿子： qsub -S /bin/bash -A assembly -pe threads 16 -l mem=2GB -cwd -N "pBcR_correct_asm" -j y -o /dev/null runCorrection.sh Unable to
    qsub sungridengine 2016-08-05

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    在qsub下重定向我的java程序的輸出

    我目前使用qsub運行多個Java可執行程序。 我寫了兩個劇本：1）qsub.sh，2）run.sh文件 qsub.sh #! /bin/bash echo cd `pwd` \; "[email protected]" | qsub run.sh #! /bin/bash for param in 1 2 3 do ./qsub.sh java -jar myProgram.jar
    pbs qsub sungridengine queueing 2016-08-08

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    SGE提交的作業不運行

    我在我的ubuntu 14.04上使用Sun Grid Engine將我的作業排隊等待在多核CPU上運行。 我已經在我的系統上安裝並設置了SGE，但在測試時出現問題。我創建了一個「hello_world」目錄，它包含兩個名爲「hello_world.sh」的shell腳本，第一個包括一個簡單的命令，第二個包括qsub命令，將第一個腳本文件作爲要運行的作業提交。 下面是 「hello_world.s
    job-scheduling qsub sungridengine 2016-05-16
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