qsub

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我使用-N選項通過qsub提交時指定作業的名稱。但是，qsub會在作業名稱後添加一些數字字符串，如手冊頁中所述：默認情況下，標準輸出的文件名具有形式job_name.ojob_id和job_name.ojob_id.task_id，對於陣列作業任務（請參閱-t選項如下）。因此，無論何時提交具有相同作業名稱的新作業，都會在作業名稱中添加新的後綴.ojob_id，並創建新的輸出文件。我想要實現

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在qsub腳本中使用變量作爲參數參數

我想從文件夾中選取多個模型，並在sge腳本中將它們用於陣列作業。所以，我中SGE腳本如下： MODELS=/home/sahil/Codes/bistable/models numModels=(`ls $MODELS|wc -l`) echo $numModels #$ -S /bin/bash #$ -cwd #$ -V #$ -t 1-$[numModels] # Runnin

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太陽網格引擎中的重複作業

當我使用作業ID運行qacct時，它完成後，我得到兩個結果，我運行的一個和具有相同jobid的較舊作業。如何刪除qacct的歷史記錄？任何人都知道如何解決這個問題？謝謝 Tsvi

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提交SGE工作到PBS /轉矩

嗨我正在建立一個軟件流水線（一個廣泛的生物信息學註釋工具），最初是爲提交SGE工作而編寫的，但我在PBS /轉矩集羣上。有關將這些腳本從SGE轉換爲PBS的方法的任何想法？還是一個可以將SGE作業提交給PBS的軟件？謝謝，馬庫斯

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使用TORQUE qsub請求特定節點？

安裝了TORQUE qsub的羣集。我想發送一份工作，但我想確保它在特定的一組節點上運行。是否有可能請求qsub中的可能節點列表，以便將作業發送到請求集中的其中一個節點，而不是發送到集外的節點？

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排除TORQUE qsub請求中的特定節點

我校園中的集羣使用PBS TORQUE進行作業管理。在軟件中有幾個節點已過時。如果我的作業被髮送到其中一個節點，它將會失敗。有沒有辦法在作業請求中排除特定節點（或節點列表）？

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如何獲得max_array_size？

我正在嘗試將大型作業數組提交給羣集。 qsub請求失敗，產生Bad job array request error。我認爲這是因爲我的作業數組太大了。我如何讀取允許的最大作業數組大小？我認爲這存儲在一個名爲max_array_size的參數中，但我不確定。請注意，我不是此羣集的管理員。我只有用戶權限。

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qsub在從節點提交作業時返回錯誤

我有一個在Torque/Maui系統下運行的複雜fortran MPI應用程序。當我運行我的應用程序時，它會產生一個巨大的獨特輸出（〜20 GB）。爲了避免這種情況發生，我製作了一個RunJob腳本，它分成5個部分，每個部分產生更小的輸出，更容易處理。目前，我的RunJob腳本在第一部分的末尾正確停止，並且還生成正確的輸出。然而，當它試圖重新啓動我得到以下錯誤信息：的qsub：作業執行MSG

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如何從qsub獲取作業ID

我正在使用集羣。我將使用qsub命令分發我的作業，我想要的是我可以找回作業ID，以便我可以監控作業。基本上，我想有些事情是這樣的： #!/bin/bash JOBID=$(qsub job1) # Monitoring base on $JOBID 我發現了一個網頁http://wiki.ibest.uidaho.edu/index.php/Tutorial:_Submitting_a_

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提交到隊列後，MPI程序的計時發生了顯着變化

我有一個MPI程序，用於創建一個文件，每次迭代都有一定的計算時間。當我運行這段代碼而沒有提交隊列時（這個集羣運行SGE），它會在幾秒鐘內給出以下時間。我用mpirun -np8抓住了8個處理器。 STEP ITIME ------------- 1 0.868128 2 0.426714 3 0.409768 4 0.427312 5 0.412737 6 0.413256 7