如何在Matlab中編寫以下函數用於MS蛋白質分析？

Question

我需要你的幫助。我有超過40000種fasta文件格式的蛋白質。

首先，我想編寫一個函數：

• 即能計算出B超的創建從靶蛋白（MAT文件）的肽數據庫羣衆和y離子
• ，創建一個數據庫肽從誘餌蛋白來（MAT文件）

然後，我想：

• 負載所觀察到的數據
• 濾波器候選肽肽數據庫給予一定ppm的精度
• 編寫一個函數，分數針對所觀察到的數據的候選肽
• 拿出一個閾值方案來辨別bonafide肽從假冒的

Answer 1

要開始使用頻譜的比賽，FASTA是文本文件格式。要編寫文本文件，請檢查MATLAB文檔fopen,fprintf和fclose。要從您編寫的數據文件加載文本，您可以使用fopen，fscanf和fclose。實際上，MATLAB也有fastainfo,fastaread和fastawrite。您應該檢查這些命令的MATLAB文檔以及其他可能對您有用的FASTA相關和蛋白質分析相關命令（我還沒有做過蛋白質分析，因此我不能說哪一個是您需要的）。

而且，你問這麼多東西在一個問題，它是不可能回答所有的問題，因爲你的問題恕我直言，是一種「我怎樣寫我的整個節目？」。但我認爲你可以開始使用我列出的命令，並且當你編寫了一些代碼和你想要解決的問題時，你可以發佈一個關於它的新問題，部分代碼。

Answer 2

MATLAB的生物信息工具箱包含積木程序，你可以放在一起，以實現這一目標。如果您在將它們放在一起時遇到特定問題，請發佈具體問題。