qsub

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我一直在使用Sun Grid Engine在集羣的節點上運行我的作業。通常我會等待作業退出之前完成，我用： qsub -sync yes perl Script.pl 但是現在我不使用了Sun Grid Engine的，但PBS Pro的10.4 我不能找到相應的指令來同步。有人可以幫助我嗎？在此先感謝

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用qsub悄悄提交一份工作給SGE

我有一個bash腳本，它使用qsub提交數百個作業到一個緩慢響應的SGE隊列（每個作業ID顯示都需要很好的秒數）。爲了繞過這個耗時的過程並且在我退出我的shell時不殺死我的腳本，我通過追加&來運行我的腳本作爲後臺作業。雖然這有時可以爲我節省好半個小時，但作業ID仍然出現並且與命令提示符混淆。我想知道是否可以抑制作業ID的顯示或以某種方式悄悄地提交作業到隊列中。雖然，這link談判-z論點，它

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如何在2個計算節點和1個頭節點的扭矩集羣中運行包捕獲程序？

我使用帶有2個計算節點和1個頭節點的扭矩pbs配置了一個集羣。我使用qsub命令提交了作業，如 qsub myscript.sh myscript.sh包含一些shell代碼。這個腳本在任何計算節點中都能成功執行，並且我得到了一些輸出文件的結果。這種作業提交和執行非常簡單。但我面臨很多與以下問題... 我有一個網絡數據包捕獲模塊與C編寫的libpcap依賴項。我的要求就是這樣。我想將這個程序提交給

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缺少Java庫提交網格引擎工作

時，當我qsub命令運行Java程序我得到這個錯誤的腳本： Exception in thread "main" java.lang.UnsatisfiedLinkError: /usr/java/jdk1.6.0_16/jre/lib/amd64/xawt/libmawt.so: libXtst.so.6: cannot open shared object file: No such file

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如何動態調整StarCluster/qsub/EC2以跨多個節點運行並行作業

我是使用Startcluster/qsub/grid引擎運行並行作業的新手，我嘗試閱讀其他相關文章。我仍然不確定如何爲我的特定需求構建可擴展的解決方案。在繼續進行這項工作之前，我想先提出一些建議。這裏是我的要求：我有一個巨大的tar文件[〜40 - 50 GB，它可以達到100GB] ----->沒有太多我可以做這裏。我接受一個巨大的單個tar文件作爲輸入。我要解壓縮它 ----->我運行t

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通字符串參數

我有以下的shell腳本命名dump.sh #!/bin/sh #$ -cwd #$ -j y #module load gcc octave octave --eval "dumpoct($Nlay, $prefix);" 這個腳本加載倍頻模塊，然後評估以下倍頻功能，它只是顯示了兩個輸入參數 function dumpoct(arg1,arg2) display(arg1) di

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$ SGE_TASK_ID沒有得到設定的qsub網格陣列工作

一個非常簡單的腳本zsh： #!/bin/zsh nums=(1 2 3) num=$nums[$SGE_TASK_ID] $SGE_TASK_ID是太陽網格引擎任務ID。我正在使用qsub提交一系列作業。我下面什麼在使用qsub手冊頁（http://www.clusterresources.com/torquedocs/commands/qsub.shtml#t）建議並提交我的陣列工

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如何將值傳遞給qsub代碼的boost選項參數

我有一個程序從用戶處獲取一些值（使用boost選項傳遞參數）。 ./prog - 我的價值32 其精細到這裏，但現在我使用的qsub腳本多節點，多內核上運行的程序（和我允許使用PBS腳本只）和希望通過論證。 qsub ./xyz.sh --my-value 32 [我怎麼能這樣做？我的意思是我可以這樣做嗎？ ]

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如何使用ssh在兩個羣集之間的qsub腳本中運行本地腳本？

我正在爲2個羣集上的操作編寫腳本。我的目標是隻關注一個集羣，這意味着每個腳本源代碼只在其中一個集羣上。例如，在集羣AI已經安裝了所有的腳本，現在我想ssh到集B運行這些腳本，而不必在羣集B.重新安裝它們我知道有像ssh [email protected] 'bash -s' < local_ClusterA_script.sh然後集B bash腳本從ClusterA運行local_Clust

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將參數傳遞給perl腳本執行槽qsub

嗨想要傳遞一個參數給我的perl腳本，應該通過qsub執行。於是我運行： qsub -l nodes=node01 -v "i=500" Test.pl 雖然Test.pl我試着打電話給我分幾路參數： use Getopt::Long; $result = GetOptions ("i" => \$num); open(FILE,">/data/home/FILEout.txt");